皖南医学院公共基础学院成立于2013年，2017年成立创新创业学院。学院负责学校公共基础课程的教学工作，下设外语、体育、创新创业与劳育美育3个教研室和1个实验实训中心。创新创业学院为学校创新创业工作职能部门，统筹全校创新创业工作，具体负责“互联网+”大赛、大学生创新创业训练计划组织工作以及创新创业类课程教学工作。学校设体育、美育相关职能部门体委办公室、美育工作办公室，与公共基础学院合署办公。目前，学院持续深入推进专业英语改革、体育教学俱乐部制改革、艺术教学俱乐部制改革并取得良好效果。

学院现有在职教职工66人（包括教授7人、副教授30人），实验技术人员1人。获省级教学成果一等奖1项，省部级教学研究项目3项，省级教坛新秀称号4人。 2017来，获批教育部人文社科项目青年基金项目3项，安徽高校人文社科研究项目38项，省哲学社会科学规划青年项目3项，省高等教育振兴计划高校思政教育综合改革计划项目 1 项，省体育社会科学研究一般项目3项，校级课题44项；发表文章150余篇，其中一类期刊29篇，二类期刊9篇。

学院力争做到两覆盖、六提升，不断加强学科带头人和骨干教师的培养，优化梯队结构，形成一支以学术带头人为主体，以中青年学术骨干为支撑，具有稳定的研究方向和可持续发展能力的学术梯队，实现师资水平再提升，同时不断提高教学质量、科研水平和综合能力，打造特色鲜明、省内具有比较优势的公共基础课程，实现课程建设水平再提升。（更新于2025年1月9日）